なんとか読んだ。ATX規格において、マザボ底面から開口部端までは0.088±0.01 inch = 2.235 ± 0.254 mm らしい。
で、私のPCはここが 3 mm ちょいある。 （マスキングテープに書かれた線は1mm間隔）
思ったよりずれてない気もする。スタンドオフが黒く塗装されてたけどそれを剥がせばちょうどいい高さになるとか…？
Cooler master に 新マザボ載せてみた。一応取りつくが、パネルに対してジャックが下（左）寄り。
問題の原因は公差下限寄りのケースと公差上限寄りの新マザボだと組めないってこと…？もしそうなら運が悪すぎるし規格とはという感じもする。
状況整理
・スタンドオフが当てつく平面からパネルが取りつく窓までの高さを測定。
Fractal Design が 3 mm で Cooler Master が 5 mm くらい。
・スタンドオフはどちらも 6.5 mm
・ASUS ROG H370 （パネル一体型）は Cooler Master にはフィットしてる、Fractal Design には合わない。
推定原因
FractalDesign側に何かしらの製造ミスがある（使う治具をミスったとか？）、もしくは 2 mm 短いスタンドオフ（そんなものあるのか？）が付属していないといけなかった。
